Giải đáp vướng mắc về quy trình hoàn thuế, xử lý tiền thuế giá trị gia tăng nộp thừa thuế năm 2022?

Nội dung chính

• Hướng dẫn xử lý vướng mắc về cấu trúc xử lý mã số quản lý hải quan như thế nào?
• Cấp mã số quản lý hải quan như thế nào?
• Hướng dẫn xử lý vướng mắc về quy trình xử lý tiền thuế giá trị gia tăng nộp thừa như thế nào?

Hướng dẫn xử lý vướng mắc về cấu trúc xử lý mã số quản lý hải quan như thế nào?

Căn cứ vào Mục 1 Công văn 3301/TCHQ-TXNK năm 2022 đã có nội dung hướng dẫn như sau:

1. Vướng mắc về cấu trúc mã số quản lý hải quan

Liên quan đến việc cấp mã số quản lý hải quan đối với quyết định hoàn thuế/không thu thuế, Tổng cục Hải quan đã có công văn số 2697/TCHQ-TXNK ngày 05/7/2022 hướng dẫn các Cục Hải quan tỉnh, thành phố thực hiện (đính kèm).

Như vậy, việc xử lý vướng mắc về cấu trúc mã số quản lý hải quan sẽ đối với việc hoàn thuế hoặc khu thu thuế sẽ được xử lý theo Công văn 2697/TCHQ-TXNK năm 2022 của Tổng cục Hải quan.

Giải đáp vướng mắc về quy trình hoàn thuế, xử lý tiền thuế giá trị gia tăng nộp thừa thuế năm 2022?

Cấp mã số quản lý hải quan như thế nào?

Theo như Công văn 2697/TCHQ-TXNK năm 2022 thì Tổng cục Hải quan đã có những nội dung hướng dẫn như sau:

Căn cứ Điều 156 Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật số 80/2015/QH13 quy định về việc áp dụng văn bản quy phạm pháp luật;

Căn cứ mẫu số 13/TXNK (mẫu quyết định hoàn thuế/không thu thuế) Phụ lục I ban hành kèm theo Thông tư số 06/2021/TT-BTC ngày 22/01/2021 của Bộ Tài chính quy định: "Công chức xử lý hồ sơ thực hiện cấp mã số quản lý hải quan theo cấu trúc: Mã Chi cục Hải quan/Số thứ tự/Năm/Mã hoàn thuế/Mã loại hình tờ khai".

Căn cứ quy định nêu trên, việc cấp mã số quản lý hải quan đối với Quyết định hoàn thuế/không thu thuế thực hiện như sau:

1. Trường hợp hồ sơ giấy: Sau khi Lãnh đạo đơn vị ký Quyết định hoàn thuế/không thu thuế, công chức xử lý hồ sơ thực hiện cấp mã số quản lý hải quan thực hiện theo hướng dẫn tại mẫu số 13/TXNK Phụ lục I ban hành kèm theo Thông tư số 06/2021/TT-BTC (mẫu quyết định hoàn thuế/không thu thuế).

Nội dung hướng dẫn tại mục 1 công văn này thay thế nội dung hướng dẫn về mã số quản lý hải quan đối với trường hợp hồ sơ giấy tại tiết a.2 khoản 3 Điều 19, khoản 3 Điều 23, khoản 5 Điều 24 Quyết định số 3394/QĐ-TCHQ ngày 31/12/2021 của Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan.

2. Trường hợp hồ sơ điện tử: Sau khi Lãnh đạo phê duyệt Quyết định hoàn thuế/không thu thuế trên Hệ thống miễn giảm hoàn, Hệ thống tự động cấp mã số quản lý hải quan như hướng dẫn tại tiết a.l khoản 3 Điều 19, khoản 3 Điều 23, khoản 5 Điều 24 Quyết định số 3394/QĐ-TCHQ.

Theo đó, công chức xử lý hồ sơ sẽ cấp mẫ số quản lý hải quan theo cấu trúc mã Chi cục Hải quan/Số thứ tự/Năm/Mã hoàn thuế/Mã loại hình tờ khai theo mẫu số 13/TXNK Phụ lục I ban hành kèm theo Thông tư 06/2021/TT-BTC.

Hướng dẫn xử lý vướng mắc về quy trình xử lý tiền thuế giá trị gia tăng nộp thừa như thế nào?

Căn cứ vào Mục 2 Công văn 3301/TCHQ-TXNK năm 2022 đã có nội dung hướng dẫn như sau:

2. Vướng mắc về quy trình xử lý tiền thuế nộp thừa

Căn cứ điểm g khoản 1 Điều 26 chương IV Quyết định số 3394/QĐ-TCHQ ngày 31/12/2021 của Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan về việc kiểm tra hồ sơ quy định: “Trường hợp hoàn thuế giá trị gia tăng nộp thừa của năm trước nhưng ban hành quyết định hoàn thuế sau ngày 31/3 của năm kế tiếp, cơ quan hải quan cần thu thập thông tin từ cơ quan thuế địa phương để phục vụ việc hoàn thuế thì cơ quan hải quan có văn bản gửi cho cơ quan Thuế địa phương nơi quản lý doanh nghiệp đề nghị cung cấp thông tin, số liệu kê khai nộp thuế, báo cáo quyết toán thuế của người nộp thuế để phục vụ việc hoàn thuế”.

Căn cứ quy định nêu trên, cơ quan hải quan cần thu thập thông tin từ cơ quan thuế địa phương để phục vụ việc hoàn thuế đối với trường hợp hoàn thuế GTGT nộp thừa của năm trước nhưng ban hành quyết định hoàn thuế sau ngày 31/3 của năm kế tiếp đối với các trường hợp sau:

- Người nộp thuế trong thời hạn 12 tháng tính đến ngày nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT nộp thừa có hành vi vi phạm pháp luật về hải quan, pháp luật về thuế, pháp luật khác có liên quan đang bị cơ quan có thẩm quyền khởi tố vụ án hình sự;

- Người nộp thuế là công ty thành viên trong cùng một tập đoàn nhưng tập đoàn đang bị khởi tố vụ án hình sự hoặc đơn vị thành viên khác trong cùng một tập đoàn đang bị khởi tố vụ án hình sự;

- Người nộp thuế có số tiền thuế GTGT đề nghị hoàn từ 500 triệu đồng trở lên;

- Người nộp thuế không giải trình được những mâu thuẫn trong hồ sơ đề nghị hoàn tiền thuế GTGT nộp thừa;

- Các trường hợp khác mà cơ quan hải quan có nghi ngờ trong quá trình xử lý hồ sơ hoàn thuế GTGT nộp thừa của người nộp thuế.

Cơ quan hải quan phải theo dõi, đôn đốc phối hợp với cơ quan thuế. Ngay sau khi nhận được ý kiến của cơ quan thuế, căn cứ văn bản quy phạm pháp luật, hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT nộp thừa của người nộp thuế, cơ quan hải quan có văn bản phản hồi cho người nộp thuế.

Đối với các trường hợp hoàn tiền thuế GTGT nộp thừa của năm trước nhưng cơ quan hải quan có đủ cơ sở xác định doanh nghiệp chưa kê khai khấu trừ hoặc hoàn thuế tại cơ quan thuế thì không cần thu thập thêm thông tin từ cơ quan thuế địa phương.

Theo đó thì cơ quan hải quan sẽ tiến hành thu thập thông tin từ cơ quan thuế địa phương để phục phục vụ việc hoàn thuế giá trị gia tăng nộp thừa của năm trướng những quyết định hoàn thuế được ban hành sau ngày 31/3 của năm kế tiếp khi thuộc một trong những trường hợp hướng dẫn trên.

Nếu như có đủ căn cứ để xác định doanh nghiệp chưa kê khai khấu trừ hoặc hoàn thuế giá trị gia tăng tại cơ quan thuế thì cơ quan hải quan không cần thu thập thông tin từ cơ quan thuế địa phương.